Kompetensi Khas Madrasah adalah program yang dirancang untuk memastikan kesiapan siswa dalam hal-hal dasar ubudiyyah, agar siswa tidak hanya cerdas secara akademik, tetapi juga paham, mendalami, dan mampu mempraktikkannya dalam kehidupan sehari-hari.
Setiap menjelang asesmen, baik asesmen tengah semester maupun akhir semester, siswa MA Tajul Ulum akan melaksanakan Uji Kompetensi Khas Madrasah dengan materi yang berbeda di setiap tingkatan kelas.